本项目获得广东省科技计划项目农村科技领域经费资助（2014B020202004），总经费100万元。本项目共收集种质资源30余分，并创制黑皮双边籽优质材料4份；完成了冬瓜全基因组De Novo测序，对146份不同生态型核心种质进行基因组重测序；基于SLAF技术构建冬瓜高密度遗传连锁图谱，共包含4607个标记、12个连锁群；遗传规律分析显示皮色是由一对基因控制的质量性状，黑色对黄色为显性，基于冬瓜遗传连锁图谱和表型性状，在5号连锁群35.6cM处检测到1个基因位点；分析冬瓜籽型基因的遗传规律，结果显示籽型是由一对基因控制的质量性状，双边对单边为显性，基于遗传图谱和表型性状，在4号连锁群检测到1个基因位点；基于146份冬瓜基因组重测序信息，利用GWAS方法定位了籽型基因，其定位结果与利用遗传图谱的结果完全一致；育成冬瓜新品种2个，分别是铁柱2号冬瓜和墨宝冬瓜，均通过广东省农作物品种审定，并申报了植物新品种权保护。

    1、铁柱2号冬瓜 以囊腔小，耐贮运为主要育种目标，2012年开始选择植株生长健壮、皮色黑、肉质致密、瓜形美观、坐瓜性好、抗逆性强、休眠期短的株系，利用皮色分子标记以及籽型分子标记进行筛选，筛选出双边籽型、皮色深黑的资源材料，在此基础上，根据亲本来源的地域性、遗传特性和品种特性，选择差异大，遗传性状互补的株系进行配组，经配合力测定和多次品比，从40多个杂交组合中筛选出综合性状表现优良、囊腔小、耐贮运、休眠期短的18号组合，命名为“铁柱2号”黑皮冬瓜。该杂交组合瓜形为长圆柱形，皮色墨绿、瓜大、浅棱沟、表皮光滑、品质优良，产量高，囊腔小，肉质致密，特耐贮运，双边籽。2015年10通过现场鉴定，2016年通过广东省农作物品种审定，审定号为粤审菜20160016。

    2、墨宝冬瓜 针对现有小冬瓜品种在肉质、皮色上的缺陷，以肉质紧密、皮色墨绿为主要育种目标，同时兼顾抗病抗逆及产量等综合性状，开展小冬瓜新品种选育工作。经配合力测定和品比试验，从10余个组合中筛选出果形美观、果肉致密、皮色墨绿、抗病抗逆等综合性状表现优良的小冬瓜组合S7×自选F3，2015年定名为“墨宝”。该组合瓜形美观、肉质紧实、皮色墨绿、无网纹、无棱沟、无蜡粉，双边籽，抗病抗逆性较强、耐贮运，冬瓜风味浓。2016年通过现场鉴定，2017年通过广东省农作物品种审定，审定号为粤审菜20170005。

    本项目共发表学术论文7篇，其中SCI论文2篇；2名项目组成员晋升为高级职称；获得广东省科学技术奖二等奖1项；申请植物新品种权保护2个，申请国家发明专利1件。在项目实施期间对铁柱2号冬瓜和墨宝冬瓜进行示范推广，累计示范面积超过5000亩。