中国沿海海马蕴藏量丰富，但对海马进行资源调研和种群特征研究并没有与国际接轨；中国沿海的海马资源研究是国际海马研究的唯一空白区域，对该区域进行海马种群与资源特征研究将是国际海马种群研究的重要补充（Lourie and Vincent, 2004）。

    本项目完成中国近海所有海马种类的照片图册，保存了其中的10种海马的实物标本，并建立了所有海马种的DNA条形码库，在世界上首次测序并组装获得了海马全基因组数据（Lin et al., 2016, Nature 封面论文; Lin et al., 2017, Gaga Science）。厘清中国近海海马物种组成和优势种，明确了海马的种间遗传关系和进化地位（Zhang et al., 2017, Fish Res），建立了海马种类的SSR和SNP标记分子鉴定方法 (Luo et al., 2015, Fish Res)，成功发现一个海马新种(Zhang et al., 2017, Zootaxa)，首次明确了日本海马的季节性洄游繁殖的生活史特征(Qin et al., 2017, ICES J Mar Sci)。基于线粒体序列和SSR标记，比较了野生群体和养殖群体的遗传多样性，首次评估了养殖条件对海马种群遗传多样性的影响 (Luo et al., 2015, Fish Res)；基于线粒体序列，明确中国近海优势海马种三斑海马和日本海马不同地理群体间基因流普遍存在，未形成明显的种群分化(Qin et al., 2017, ICES J Mar Sci; Liu et al., 2015, Mitochondrial DNA)。对养殖海马的交配、怀孕和产幼行为进行了详细的观察描述，并对饵料、温度、性比等因素对海马繁殖行为的影响进行了分析，基于此建立了优化的海马饲喂和配对等养殖条件（秦耿，2016，博士论文；Wang et al., 2016, J Fish Dis；Luo et al., 2016, Fish Shellfish Immu）；同时，针对养殖海马种质衰退这一问题，建立了多种海马人工育种方法。对海马性腺发育和胚胎发育进行了系统的组织学观察和转录组学分析，并基于海马全基因组对海马雄性育儿繁殖策略的分子调控机制进行了深入探讨，相关成果以Nature封面论文形式发表（Lin et al., 2016, Nature 封面论文; Lin et al., 2017, Gaga Science）；基于相关成果，建立多种提高海马繁殖效率的养殖技术方法，并实现大规模推广。

    基于本项目资助，共发表相关科研论文21篇，重要成果在Nature杂志以封面论文形式发表，申请或授权国家发明相关专利9项，其中一项为国际发明专利，培养硕士生1名，博士生1名；技术成果集成后，在我国沿海多个省份实现大规模推广，并获得广东省科技成果鉴定证书。