一、课题来源与背景： 自2014年以来，本项目通过与省内外科研机构“产学研用”深度合作，应用基因组育种技术、转录组及蛋白组技术研究手段，开展多性状基因组联合精准育种技术创新研究与集成应用，并通过体细胞克隆和高效精液生产技术构建高效的育繁推一体化的优质基因传递模式。 主要任务来源包括1项国家自然科学基金面上项目、1项国家自然科学基金青年项目、1项广东省科技计划项目和多项横向课题研究。主要科技计划项目如下： ①国家自然科学基金面上项目 项目名称：《用多重组学数据整合分析策略解析猪血液T淋巴细胞多样性的遗传调控机制》 项目编号：31372302 ；研究周期：2014-2017 ②国家自然科学基金青年项目 项目名称：《猪精液蛋白OPN和CRISP1表达差异与种公猪繁殖力的相关性及其机制研究》 项目编号：31402072 ；研究周期：2015-2017 ③广东省科技计划项目—农村科技领域 项目名称：《提高种公猪繁殖能力的相关技术研究集成与示范》 项目编号：2015A020208015 ；研究周期：2015-2017 。

    二、技术原理及性能指标： 1.技术原理 种猪的各项生产性状及表型主要取决于其基因型，亦受到多种外在环境因素的影响。本项目基于种猪表型测定大型数据库和基因组信息，应用基因组选育技术，结合转录组及蛋白组研究建立多性状种猪早期精准选育技术体系，提高选育准确率，降低选育成本。创建高效的体细胞克隆技术，实现优秀种公猪的快速扩繁，扩大猪群优良基因覆盖度。打造精液品控体系、猪精安全生产体系，优化深部输精技术，集成了优秀公猪基因高效传递技术体系，提高精液生产及输精效率。 2.性能指标 （1）构建了种猪早期精准选育技术体系：提高选育准确率，降低50%选育成本，对扬翔等公司种公猪进行高强度选育，核心群种公猪选留率在1%以下，年更新率达到100%。 （2）鉴定出一批与肉质性状（影响肌内脂肪沉积）、抗病力和公猪精液质量相关的关键候选基因和分子标记，并揭示了其调控机制。 （3）建立了利用精液蛋白标记选育高繁殖力种公猪的方法，以IZUMO2蛋白标记选育高繁种公猪的最佳选留比例为68%，以SPACA4蛋白标记选育高繁种公猪的最佳选留比例为77%。 （4）打造了种公猪体细胞克隆扩繁技术体系，实现了优秀种猪高效快速扩繁和产业化，其克隆后代的一致性、生长性能、瘦肉率和饲料效率均高于非克隆后代。 （5）构建规模化公猪站猪精“生产-品控-包装-配送”全流程生产和品控体系，公猪精液产能提升20%，实现优秀基因产业化推广，在行业内首次获得精液生产ISO9001认证。探索出低剂量深部输精技术，在不降低受胎率和产仔数的情况下，使商品精规格从20亿/80mL调整为12亿/60mL，优秀公猪利用效率提升60%。

    三、技术的创造性与先进性： 本项目开发了种猪测定系统软件，创建了大型的精准表型数据库；基于基因组信息鉴定出一批新的与肉质、免疫、精液性状等相关的关键候选基因和分子标记，并揭示了其调控机制；创建了应用精液蛋白标记选育高繁殖力种公猪的方法；创建高效体细胞克隆技术并开创性地用于种公猪批量扩繁；集成了优秀公猪基因高效传递技术。

    四、技术的成熟程度，适用范围和安全性： 本项目高品质猪精液已经在全国范围内的养猪公司中推广应用，得到了各级政府、行业协会和从业技术人员的广泛接受和认可，技术操作简单易行，并已经产生了巨大的经济利益；通过温氏股份和扬翔股份区域公猪站，将顶级克隆猪精液面向社会配送，可大大提高优秀种公猪精液的利用率，扩大优良基因的覆盖面，助力养猪业肉猪性能提高，推广范围及产生的经济价值巨大；本项目技术的成熟程度已获得市场检验和业界高度认可，适用范围主要用于猪遗传育种与繁殖方面；技术操作简单易行和安全性高。

    五、应用情况及存在问题。 1.应用情况： 项目技术和产品成果应用于全国范围内，创造了显著的经济效益。近三年，项目育种技术在广东温氏种猪科技有限公司、清远温氏种猪科技有限公司、滁州华农畜牧有限公司、广西春雨农牧有限公司、广西海和种猪有限责任公司、广西五祥农牧有限责任公司、广西牟村农牧有限公司、广西天地和农牧科技有限公司和岳阳晓猪科技有限责任公司等10家种猪企业进行推广应用，覆盖这些企业47.88万头后备种猪育种值评估及1053.26万头商品猪生产，育种技术推广带来的性能提升及成本的降低，给这些企业带来直接巨大的经济效益，新增销售额12.10亿元，新增利润4.68亿元。 2.存在的问题： 目前国内很多企业或养殖户开展育种工作的能力不强，表型测定量偏低，种猪选育与国外专业化种猪公司相比，选育性状少，育种指数组成简单，且国内疾病多，环境不稳定，导致遗传工作不能持续有效开展，极大程度上限制了种猪育种工作的发展。