广东省积极探索建立以绩效为导向的部门整体预算管理模式，建立部门整体支出核心绩效指标体系，规范标准化的部门整体支出绩效管理机制。在此背景下，科技部门也应从核心职能入手，设立共性与个性兼备的部门整体支出核心绩效指标体系，积极响应财政部“一个部门一套指标体系”的号召。 广东省部门整体支出核心绩效指标梳理是围绕部门和单位职责、行业发展规划，以预算资金管理为主线，统筹考虑资产和业务活动，从运行成本、管理效率、履职效能、社会效应、可持续发展能力和服务对象满意度等方面，衡量部门和单位整体及核心业务实施效果。其中部门整体支出核心绩效指标以个性的效益指标为主，共性的管理指标为辅，而共性的管理指标又包括行政运行成本指标，例如人均公用经费、人均差旅费、人均培训费等。部门整体支出核心绩效指标体系建设的核心思路是从部门核心职能入手，制定好任务目标后选取对应的宏观指标进行分析，再根据预算项目等大事要事选取对应的微观指标，从而构成一个完整的评价体系。

    在部门整体支出核心绩效指标体系的总体框架中，主要有两类指标，分别是任务类指标（第一层级）和项目类指标（第二层级）。任务类指标来源于部门“三定”方案、省委、省政府重大战略或行业发展规划，反映部门法定职责，此类指标具有较强的稳定性和导向性，在规划期内一般不调整。而项目类指标来源于大事要事清单、预算项目、年度重点工作等，此类指标在保持一定的稳定性基础上，具有相对的灵活性，可根据省委、省政府年度重点工作变化、项目实施进展等进行必要的调整。 指标体系的建设遵循以下三点原则：第一，体系完整。不是部门碎片化工作的简单整合，而是覆盖科技部门的核心职能，系统呈现部门的核心履职效能、社会效应。以结果性、效益类指标为主，过程性、产出类指标为辅，共性、管理类指标兼顾。第二，标准科学。基于科技部门法定职责和发展规划，实现纵向细分、横向比较，设定的指标值有依有据。第三，客观量化。指标、指标值、历史值等有明确可追溯的来源，强调数据的客观性、权威性、和可衡量性（可量化）。 通过建立核心绩效指标体系，一是，能够全面体现科技部门的职责定位、社会贡献和作用，让公众知道本部门是做什么的，让省委、省政府了解科技部门的工作成绩。二是，能够充分反映资金申请、安排的理由，对应的预算项目有助于实现本部门的重点任务要求。三是，对科技部门二级预算单位从职能定位、目标设置、发展规划到全面预算绩效管理、评价考核、结果运用等都具有积极的指导意义和推进作用。